·針對(duì)北京地區(qū)病例的分析表明，中國(guó)近期疫情中未見新的COVID-19變異株。
(資料圖)
《柳葉刀》發(fā)表高福團(tuán)隊(duì)研究論文。
中國(guó)逐步調(diào)整防疫措施后，新冠感染病例數(shù)量激增，引發(fā)人們對(duì)可能出現(xiàn)新的變異株的擔(dān)憂。針對(duì)北京地區(qū)2022年11月14日至12月20日期間采集的413例新冠（COVID-19）感染新發(fā)病例樣本進(jìn)行的基因組分析表明，所有病例均由現(xiàn)有毒株引起，90%以上涉及奧密克戎（Omicron）變異株BA.5.2或BF. 7亞分支，未見新的變異株。
北京時(shí)間2月9日，《柳葉刀》（The Lancet）在線發(fā)表了這項(xiàng)研究。文章作者表示，由于北京人口的特點(diǎn)以及高傳染性新冠毒株在北京地區(qū)的傳播情況，上述結(jié)果是中國(guó)大流行的縮影。
該研究由中國(guó)國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃和中科院戰(zhàn)略優(yōu)先研究計(jì)劃資助，由北京疾病預(yù)防控制中心、中國(guó)科學(xué)院、中國(guó)疾病預(yù)防控制中心和中國(guó)科學(xué)院大學(xué)的研究人員進(jìn)行，北京市疾控中心副主任王全意與中國(guó)科學(xué)院院士、中國(guó)科學(xué)院微生物研究所研究員高福為通訊作者。
2022年11月14日至12月20日，北京地區(qū)發(fā)現(xiàn)的局部亞變異株。來(lái)源：柳葉刀
文章稱，自2019年12月以來(lái)，本研究的作者定期收集北京地區(qū)輸入型病例和本地新冠病例的呼吸道樣本，并隨機(jī)選擇樣本進(jìn)行分析。在2022年12月之前，未有關(guān)于病毒在北京地區(qū)本地持續(xù)傳播的報(bào)告。在這項(xiàng)最新研究中，作者對(duì)北京地區(qū)2022年檢出的新冠病毒樣本進(jìn)行了分析。使用快速、大規(guī)模測(cè)序技術(shù)生成基因組序列，并使用現(xiàn)有的高質(zhì)量新冠病毒序列分析其進(jìn)化歷程和種群動(dòng)態(tài)。
研究共納入2881個(gè)高質(zhì)量序列（其中境外輸入型病例來(lái)自63個(gè)國(guó)家和地區(qū)），在2022年11月14日（感染病例數(shù)量開始急劇增加）至12月20日期間，隨機(jī)選擇了413個(gè)新樣本進(jìn)行測(cè)序。其中350例為本地病例，63例為輸入型病例。
對(duì)413個(gè)新序列的分析表明，其均屬于現(xiàn)有已知的新冠毒株。2022年11月14日之后，北京地區(qū)的優(yōu)勢(shì)毒株為BF.7，占本地感染病例的75.7%。另一種奧密克戎變異株亞分支BA.5.2占本地感染病例的16.3%。同期輸入型病例涉及毒株包括BQ.1和XBB.1，分別占20株和6株，它們是國(guó)際間占主導(dǎo)地位的變異株，但在北京本土感染病例中并未檢出。
左圖為2022年全年在北京流行的新冠病毒變異株的組成，右圖為2022年11月14日之后在北京傳播的新冠病毒變異株的組成。 內(nèi)圈代表分支的組成，外圈代表每個(gè)分支中的詳細(xì)譜系（Pango lineage）。來(lái)源：柳葉刀
2022年11月14日之后，北京地區(qū)的BA.5.2和BF.7有效種群數(shù)量均有所增加，表明這兩個(gè)譜系內(nèi)的遺傳多樣性增加。BA.5.2有效種群大小在2022年11月14日至25日之間無(wú)顯著變化，但在2022年11月30日前后急劇增加。與此同時(shí)，2022年11月30日前后的BA.5.2感染病例數(shù)量也有所增加。自2022年11月14日起，BF.7的種群大小逐漸增加。
北京地區(qū)BA.5.2（左）和BF.7（右）有效種群數(shù)量增加的時(shí)間軸。來(lái)源：柳葉刀
作者承認(rèn)本項(xiàng)研究存在一些局限性。雖然只對(duì)北京地區(qū)2022年的數(shù)據(jù)（而非中國(guó)大陸的數(shù)據(jù)）進(jìn)行了分析，但作者表示，這些數(shù)據(jù)可代表全國(guó)的情況。由于強(qiáng)制性大規(guī)模檢測(cè)結(jié)束，無(wú)法獲得2022年12月經(jīng)實(shí)驗(yàn)室確認(rèn)的新冠病例數(shù)，表明真實(shí)感染病例數(shù)被低估，導(dǎo)致數(shù)據(jù)中存在一定程度的抽樣偏倚。需要更多的樣本來(lái)研究奧密克戎變異株亞分支的傳播性和致病性。雖然病毒的進(jìn)化速度可能因變異株的不同而存在差異，但作者認(rèn)為，在疫情暴發(fā)初期，病毒的進(jìn)化速度是恒定的。
高福向《柳葉刀》表示：“鑒于變異株對(duì)疫情進(jìn)程的影響，有必要調(diào)查中國(guó)近期調(diào)整COVID-19防控政策后是否出現(xiàn)新的變異株。我們的分析表明，兩種已知的奧密克戎變異株亞分支（而非任何新的變異株）是北京地區(qū)當(dāng)前病例數(shù)激增的主要原因，而且放眼整個(gè)中國(guó)，可能同樣適用。然而，隨著COVID-19在中國(guó)的大規(guī)模傳播，我們有必要繼續(xù)密切監(jiān)測(cè)疫情，以便盡早發(fā)現(xiàn)可能出現(xiàn)的任何新變異株。”
“世界迫切需要來(lái)自中國(guó)所有地區(qū)和其他地方的及時(shí)的基因組和其他數(shù)據(jù)，例如病例數(shù)和死亡人數(shù)的可靠數(shù)字。快速暢通的重要數(shù)據(jù)流通是應(yīng)對(duì)持續(xù)的新冠肺炎疫情和許多其他健康威脅的關(guān)鍵。”南非斯坦陵布什大學(xué)（University of Stellenbosch）的Wolfgang Preiser教授和Dr Tongai Maponga在《柳葉刀》配發(fā)的文章評(píng)論中寫道：“我們很高興看到來(lái)自中國(guó)的這些急需的數(shù)據(jù)。令人欣慰的是，該研究并未發(fā)現(xiàn)關(guān)于新變異株的證據(jù)，但這一結(jié)果也并非在意料之外：有效控制措施的突然停止可充分解釋病例數(shù)量的激增。”
然而，他們表示，在根據(jù)北京地區(qū)的數(shù)據(jù)得出全國(guó)情況的結(jié)論時(shí)仍需謹(jǐn)慎。“對(duì)于一個(gè)幅員遼闊、人口稠密的大國(guó)，不能根據(jù)單個(gè)地區(qū)的新冠病毒（SARS-CoV-2）分子流行病學(xué)特征推斷整個(gè)國(guó)家的狀況。在中國(guó)的其他地區(qū)，可能會(huì)出現(xiàn)其他進(jìn)化動(dòng)態(tài)，其中可能包括可被人類感染且進(jìn)一步進(jìn)化后發(fā)生‘回溢’（spill back）的動(dòng)物病毒。”
參考文獻(xiàn)：
https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(23)00129-0/fulltext